Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP3P10745 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP3P10745 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP3P10745 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP3P10745 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP3P10745 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP3P10745 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP3P10745 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP3P10745 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP3P10745 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP3P10745 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP3P10745 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP3P10745 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP3P10745 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP3P10745 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP3P10745 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP3P10745 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP3P10745 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP3P10745 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP3P10745 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP3P10745 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP3P10745 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP3P10745 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP3P10745 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP3P10745 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP3P10745 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP3P10745 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP3P10745 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP3P10745 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP3P10745 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP3P10745 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP3P10745 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP3P10745 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP3P10745 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP3P10745 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP3P10745 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP3P10745 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP3P10745 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP3P10745 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP3P10745 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP3P10745 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP3P10745 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP3P10745 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP3P10745 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP3P10745 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP3P10745 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP3P10745 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP3P10745 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP3P10745 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP3P10745 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP3P10745 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP3P10745 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP3P10745 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP3P10745 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP3P10745 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP3P10745 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP3P10745 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBP3P10745 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms