Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PF4V1P10720 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PF4V1P10720 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms