Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM200BP0CF97 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM200BP0CF97 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms