Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM228BP0C875 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM228BP0C875 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms