Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPLP06858 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPLP06858 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPLP06858 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPLP06858 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPLP06858 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPLP06858 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPLP06858 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPLP06858 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPLP06858 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPLP06858 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPLP06858 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPLP06858 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LPLP06858 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPLP06858 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPLP06858 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPLP06858 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPLP06858 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPLP06858 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPLP06858 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPLP06858 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPLP06858 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPLP06858 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPLP06858 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPLP06858 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPLP06858 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPLP06858 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPLP06858 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPLP06858 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPLP06858 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPLP06858 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LPLP06858 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPLP06858 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPLP06858 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPLP06858 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPLP06858 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPLP06858 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPLP06858 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPLP06858 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPLP06858 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPLP06858 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPLP06858 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPLP06858 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPLP06858 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LPLP06858 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPLP06858 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPLP06858 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPLP06858 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPLP06858 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPLP06858 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPLP06858 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPLP06858 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPLP06858 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPLP06858 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPLP06858 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LPLP06858 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPLP06858 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPLP06858 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LPLP06858 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms