Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAVP06756 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms