Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAP2AP05549 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAP2AP05549 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms