Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYCNP04198 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYCNP04198 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYCNP04198 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYCNP04198 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYCNP04198 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYCNP04198 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYCNP04198 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MYCNP04198 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYCNP04198 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYCNP04198 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MYCNP04198 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MYCNP04198 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYCNP04198 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYCNP04198 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYCNP04198 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYCNP04198 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYCNP04198 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYCNP04198 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYCNP04198 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MYCNP04198 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYCNP04198 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYCNP04198 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYCNP04198 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYCNP04198 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYCNP04198 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYCNP04198 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MYCNP04198 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYCNP04198 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYCNP04198 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYCNP04198 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYCNP04198 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYCNP04198 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYCNP04198 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYCNP04198 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYCNP04198 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYCNP04198 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYCNP04198 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYCNP04198 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYCNP04198 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYCNP04198 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYCNP04198 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYCNP04198 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYCNP04198 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYCNP04198 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYCNP04198 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYCNP04198 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYCNP04198 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYCNP04198 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYCNP04198 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYCNP04198 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYCNP04198 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYCNP04198 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYCNP04198 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYCNP04198 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYCNP04198 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYCNP04198 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYCNP04198 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.8 ms