Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms