Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms