Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR2O75167 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms