Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBNO60934 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBNO60934 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBNO60934 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBNO60934 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBNO60934 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBNO60934 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NBNO60934 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBNO60934 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBNO60934 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBNO60934 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBNO60934 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBNO60934 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBNO60934 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBNO60934 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBNO60934 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NBNO60934 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBNO60934 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBNO60934 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBNO60934 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBNO60934 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBNO60934 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBNO60934 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBNO60934 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBNO60934 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBNO60934 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBNO60934 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBNO60934 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBNO60934 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBNO60934 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBNO60934 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBNO60934 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBNO60934 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBNO60934 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBNO60934 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBNO60934 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NBNO60934 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBNO60934 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBNO60934 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBNO60934 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NBNO60934 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NBNO60934 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NBNO60934 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBNO60934 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBNO60934 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBNO60934 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBNO60934 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBNO60934 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBNO60934 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBNO60934 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBNO60934 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NBNO60934 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBNO60934 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBNO60934 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBNO60934 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBNO60934 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBNO60934 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBNO60934 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBNO60934 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBNO60934 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBNO60934 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBNO60934 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBNO60934 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBNO60934 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBNO60934 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NBNO60934 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NBNO60934 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NBNO60934 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBNO60934 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBNO60934 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBNO60934 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBNO60934 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBNO60934 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBNO60934 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBNO60934 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBNO60934 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBNO60934 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBNO60934 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBNO60934 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBNO60934 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBNO60934 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBNO60934 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBNO60934 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBNO60934 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBNO60934 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBNO60934 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBNO60934 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms