Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR5O60602 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR5O60602 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR5O60602 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR5O60602 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR5O60602 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR5O60602 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR5O60602 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR5O60602 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR5O60602 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR5O60602 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR5O60602 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR5O60602 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR5O60602 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR5O60602 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR5O60602 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR5O60602 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR5O60602 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR5O60602 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR5O60602 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR5O60602 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR5O60602 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR5O60602 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR5O60602 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR5O60602 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR5O60602 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR5O60602 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR5O60602 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR5O60602 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR5O60602 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR5O60602 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR5O60602 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR5O60602 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR5O60602 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR5O60602 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR5O60602 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR5O60602 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR5O60602 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR5O60602 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR5O60602 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR5O60602 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR5O60602 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR5O60602 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR5O60602 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR5O60602 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR5O60602 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR5O60602 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR5O60602 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR5O60602 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR5O60602 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR5O60602 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR5O60602 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR5O60602 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR5O60602 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR5O60602 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR5O60602 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR5O60602 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR5O60602 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR5O60602 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR5O60602 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR5O60602 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR5O60602 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR5O60602 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR5O60602 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR5O60602 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR5O60602 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR5O60602 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR5O60602 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR5O60602 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR5O60602 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR5O60602 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR5O60602 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms