Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms