Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BNIP3LO60238 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms