Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC28A2O43868 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC28A2O43868 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms