Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP9O43818 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP9O43818 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP9O43818 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP9O43818 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP9O43818 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP9O43818 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP9O43818 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP9O43818 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP9O43818 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP9O43818 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP9O43818 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP9O43818 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP9O43818 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP9O43818 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP9O43818 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP9O43818 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP9O43818 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP9O43818 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP9O43818 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP9O43818 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP9O43818 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP9O43818 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP9O43818 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP9O43818 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP9O43818 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP9O43818 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP9O43818 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP9O43818 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP9O43818 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP9O43818 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRP9O43818 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP9O43818 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP9O43818 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP9O43818 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP9O43818 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP9O43818 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP9O43818 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP9O43818 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP9O43818 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP9O43818 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP9O43818 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP9O43818 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP9O43818 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP9O43818 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP9O43818 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP9O43818 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP9O43818 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP9O43818 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP9O43818 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP9O43818 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP9O43818 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP9O43818 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP9O43818 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP9O43818 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP9O43818 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP9O43818 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP9O43818 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP9O43818 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP9O43818 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP9O43818 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP9O43818 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP9O43818 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP9O43818 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP9O43818 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP9O43818 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP9O43818 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP9O43818 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP9O43818 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP9O43818 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP9O43818 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP9O43818 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP9O43818 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP9O43818 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP9O43818 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP9O43818 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP9O43818 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP9O43818 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP9O43818 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP9O43818 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP9O43818 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP9O43818 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP9O43818 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP9O43818 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP9O43818 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP9O43818 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP9O43818 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP9O43818 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP9O43818 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP9O43818 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP9O43818 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP9O43818 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP9O43818 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP9O43818 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP9O43818 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP9O43818 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP9O43818 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP9O43818 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP9O43818 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP9O43818 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms