Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR1O43759 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR1O43759 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms