Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3O43617 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC3O43617 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms