Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK2O43353 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK2O43353 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms