Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM6AO15550 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM6AO15550 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms