Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2DO15514 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms