Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN3O15232 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN3O15232 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN3O15232 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN3O15232 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN3O15232 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN3O15232 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN3O15232 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN3O15232 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN3O15232 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN3O15232 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN3O15232 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN3O15232 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN3O15232 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN3O15232 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN3O15232 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN3O15232 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN3O15232 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN3O15232 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN3O15232 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN3O15232 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN3O15232 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MATN3O15232 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MATN3O15232 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MATN3O15232 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN3O15232 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN3O15232 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN3O15232 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN3O15232 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN3O15232 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN3O15232 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN3O15232 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN3O15232 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN3O15232 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN3O15232 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN3O15232 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN3O15232 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN3O15232 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN3O15232 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN3O15232 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN3O15232 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN3O15232 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN3O15232 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN3O15232 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN3O15232 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN3O15232 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN3O15232 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN3O15232 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN3O15232 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN3O15232 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN3O15232 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN3O15232 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN3O15232 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN3O15232 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN3O15232 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN3O15232 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN3O15232 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN3O15232 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN3O15232 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN3O15232 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN3O15232 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN3O15232 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN3O15232 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN3O15232 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN3O15232 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN3O15232 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN3O15232 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN3O15232 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN3O15232 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms