Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RIMBP2O15034 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RIMBP2O15034 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIMBP2O15034 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIMBP2O15034 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RIMBP2O15034 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIMBP2O15034 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RIMBP2O15034 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIMBP2O15034 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIMBP2O15034 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIMBP2O15034 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIMBP2O15034 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RIMBP2O15034 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIMBP2O15034 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIMBP2O15034 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RIMBP2O15034 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RIMBP2O15034 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RIMBP2O15034 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIMBP2O15034 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RIMBP2O15034 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
RIMBP2O15034 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIMBP2O15034 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RIMBP2O15034 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIMBP2O15034 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RIMBP2O15034 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RIMBP2O15034 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RIMBP2O15034 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RIMBP2O15034 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIMBP2O15034 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RIMBP2O15034 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RIMBP2O15034 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIMBP2O15034 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RIMBP2O15034 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIMBP2O15034 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIMBP2O15034 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RIMBP2O15034 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RIMBP2O15034 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RIMBP2O15034 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RIMBP2O15034 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIMBP2O15034 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RIMBP2O15034 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIMBP2O15034 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIMBP2O15034 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIMBP2O15034 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RIMBP2O15034 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.51■■■□□ 2
RIMBP2O15034 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
RIMBP2O15034 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RIMBP2O15034 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIMBP2O15034 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms