Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASKO14936 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASKO14936 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASKO14936 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASKO14936 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASKO14936 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASKO14936 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASKO14936 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASKO14936 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASKO14936 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASKO14936 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASKO14936 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASKO14936 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASKO14936 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASKO14936 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASKO14936 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASKO14936 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASKO14936 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASKO14936 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASKO14936 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASKO14936 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASKO14936 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASKO14936 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASKO14936 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASKO14936 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASKO14936 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASKO14936 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASKO14936 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASKO14936 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASKO14936 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASKO14936 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASKO14936 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASKO14936 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CASKO14936 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CASKO14936 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASKO14936 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASKO14936 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASKO14936 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASKO14936 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASKO14936 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASKO14936 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASKO14936 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASKO14936 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASKO14936 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASKO14936 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASKO14936 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASKO14936 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASKO14936 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASKO14936 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASKO14936 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASKO14936 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASKO14936 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASKO14936 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASKO14936 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASKO14936 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms