Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM38O00635 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms