Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFRD1O00458 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFRD1O00458 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms