Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIP1O00291 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIP1O00291 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIP1O00291 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIP1O00291 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIP1O00291 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIP1O00291 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIP1O00291 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIP1O00291 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIP1O00291 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIP1O00291 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIP1O00291 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIP1O00291 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIP1O00291 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HIP1O00291 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIP1O00291 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIP1O00291 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIP1O00291 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIP1O00291 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIP1O00291 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIP1O00291 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIP1O00291 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIP1O00291 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIP1O00291 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HIP1O00291 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIP1O00291 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIP1O00291 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIP1O00291 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIP1O00291 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIP1O00291 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIP1O00291 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIP1O00291 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIP1O00291 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIP1O00291 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIP1O00291 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIP1O00291 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIP1O00291 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIP1O00291 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIP1O00291 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIP1O00291 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIP1O00291 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIP1O00291 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIP1O00291 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIP1O00291 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIP1O00291 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HIP1O00291 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIP1O00291 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIP1O00291 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIP1O00291 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIP1O00291 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIP1O00291 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIP1O00291 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIP1O00291 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIP1O00291 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIP1O00291 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HIP1O00291 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIP1O00291 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIP1O00291 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIP1O00291 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HIP1O00291 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIP1O00291 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIP1O00291 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIP1O00291 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIP1O00291 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIP1O00291 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIP1O00291 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIP1O00291 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIP1O00291 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIP1O00291 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIP1O00291 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIP1O00291 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIP1O00291 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIP1O00291 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIP1O00291 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIP1O00291 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIP1O00291 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIP1O00291 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIP1O00291 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
HIP1O00291 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HIP1O00291 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIP1O00291 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIP1O00291 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIP1O00291 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIP1O00291 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIP1O00291 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIP1O00291 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIP1O00291 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIP1O00291 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIP1O00291 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIP1O00291 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HIP1O00291 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIP1O00291 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIP1O00291 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIP1O00291 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIP1O00291 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HIP1O00291 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIP1O00291 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIP1O00291 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIP1O00291 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIP1O00291 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms