Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAP23O00161 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP23O00161 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP23O00161 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP23O00161 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP23O00161 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP23O00161 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SNAP23O00161 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNAP23O00161 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP23O00161 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP23O00161 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP23O00161 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP23O00161 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP23O00161 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP23O00161 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP23O00161 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNAP23O00161 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP23O00161 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP23O00161 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP23O00161 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP23O00161 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP23O00161 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP23O00161 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP23O00161 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP23O00161 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP23O00161 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SNAP23O00161 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms