Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QKU1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QKU1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QKU1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QKU1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QKU1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QKU1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QKU1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QKU1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QKU1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QKU1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QKU1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QKU1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QKU1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QKU1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QKU1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QKU1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QKU1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QKU1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QKU1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QKU1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QKU1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QKU1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QKU1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QKU1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QKU1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QKU1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QKU1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QKU1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QKU1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QKU1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QKU1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QKU1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QKU1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QKU1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QKU1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QKU1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QKU1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QKU1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QKU1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QKU1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QKU1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QKU1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QKU1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QKU1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QKU1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QKU1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QKU1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QKU1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QKU1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QKU1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QKU1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QKU1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QKU1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QKU1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QKU1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QKU1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QKU1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QKU1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QKU1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QKU1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QKU1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QKU1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QKU1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QKU1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QKU1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QKU1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QKU1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QKU1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QKU1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QKU1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QKU1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QKU1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QKU1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QKU1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QKU1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QKU1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QKU1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QKU1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QKU1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QKU1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QKU1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QKU1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QKU1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QKU1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QKU1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QKU1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QKU1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QKU1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QKU1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms