Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms