Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNH8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNH8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNH8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNH8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNH8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNH8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNH8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNH8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNH8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNH8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNH8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNH8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNH8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNH8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNH8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNH8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNH8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNH8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNH8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNH8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNH8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNH8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BNH8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BNH8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BNH8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BNH8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
H3BNH8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.33■■□□□ 1
H3BNH8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H3BNH8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
H3BNH8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
H3BNH8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H3BNH8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BNH8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H3BNH8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BNH8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H3BNH8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BNH8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BNH8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BNH8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BNH8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BNH8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BNH8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BNH8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BNH8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BNH8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BNH8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BNH8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BNH8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BNH8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BNH8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BNH8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H3BNH8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BNH8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BNH8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BNH8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BNH8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BNH8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BNH8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BNH8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BNH8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3BNH8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3BNH8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3BNH8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H3BNH8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H3BNH8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3BNH8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3BNH8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BNH8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BNH8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H3BNH8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BNH8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H3BNH8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H3BNH8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H3BNH8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H3BNH8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.27■■□□□ 1
H3BNH8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H3BNH8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BNH8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H3BNH8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H3BNH8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H3BNH8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BNH8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BNH8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3BNH8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms