Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BM21 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BM21 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BM21 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BM21 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BM21 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BM21 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BM21 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BM21 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BM21 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BM21 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BM21 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BM21 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BM21 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BM21 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BM21 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BM21 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BM21 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BM21 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BM21 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BM21 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BM21 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BM21 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BM21 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BM21 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BM21 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BM21 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BM21 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BM21 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BM21 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BM21 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BM21 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BM21 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BM21 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BM21 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BM21 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BM21 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BM21 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BM21 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BM21 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BM21 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BM21 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BM21 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BM21 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BM21 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BM21 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BM21 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BM21 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BM21 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BM21 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BM21 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BM21 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BM21 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BM21 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BM21 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BM21 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BM21 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BM21 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BM21 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BM21 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BM21 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BM21 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BM21 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BM21 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BM21 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BM21 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BM21 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BM21 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BM21 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BM21 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BM21 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BM21 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BM21 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BM21 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BM21 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BM21 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BM21 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BM21 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms