Protein–RNA interactions for Protein: F8VWA3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VWA3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8VWA3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8VWA3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8VWA3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8VWA3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8VWA3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8VWA3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8VWA3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8VWA3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8VWA3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8VWA3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8VWA3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8VWA3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8VWA3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8VWA3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8VWA3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8VWA3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8VWA3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8VWA3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8VWA3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8VWA3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8VWA3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8VWA3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8VWA3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8VWA3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
F8VWA3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8VWA3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8VWA3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8VWA3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8VWA3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8VWA3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8VWA3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8VWA3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8VWA3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8VWA3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
F8VWA3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8VWA3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8VWA3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8VWA3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
F8VWA3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8VWA3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8VWA3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8VWA3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8VWA3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
F8VWA3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8VWA3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8VWA3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8VWA3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8VWA3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8VWA3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8VWA3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8VWA3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8VWA3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8VWA3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8VWA3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
F8VWA3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms