Protein–RNA interactions for Protein: C9JVG2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9JVG2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9JVG2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9JVG2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9JVG2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9JVG2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9JVG2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9JVG2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9JVG2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9JVG2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9JVG2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9JVG2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9JVG2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9JVG2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9JVG2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9JVG2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9JVG2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9JVG2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9JVG2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9JVG2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9JVG2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9JVG2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9JVG2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9JVG2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9JVG2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9JVG2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9JVG2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9JVG2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C9JVG2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9JVG2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9JVG2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9JVG2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9JVG2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9JVG2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9JVG2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9JVG2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9JVG2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9JVG2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9JVG2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9JVG2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9JVG2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9JVG2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9JVG2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9JVG2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9JVG2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9JVG2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9JVG2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9JVG2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9JVG2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9JVG2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9JVG2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9JVG2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9JVG2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9JVG2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9JVG2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C9JVG2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C9JVG2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9JVG2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms