Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms