Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVV-1B6SEH8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms