Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPBD1B2RD01 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPBD1B2RD01 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms