Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LIPT2A6NK58 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIPT2A6NK58 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms