Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERINC4A6NH21 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SERINC4A6NH21 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms