Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSAPA4D1B5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSAPA4D1B5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSAPA4D1B5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSAPA4D1B5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSAPA4D1B5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSAPA4D1B5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSAPA4D1B5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GSAPA4D1B5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSAPA4D1B5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSAPA4D1B5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GSAPA4D1B5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSAPA4D1B5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms