Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms