Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0U1RRA0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms