Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TBCCD1Q9NVR7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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