Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms