Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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