Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CABP7Q86V35 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms