Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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