Protein–RNA interactions for Protein: Q16625

OCLN, Occludin, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCLNQ16625 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC093915.1-201ENST00000605740 1543 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
OCLNQ16625 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms