Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CGNL1Q0VF96 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms